این شورا، بر اساس برنامه شورای مرکز مدیریت حوزه و با عنایت به شیوه مدیریتی شهیدین بهشتی و قدوسی رحمهما الله، اقدام به برنامه ریزی درسی برای سطح 2، 3 و خارج کرده و اشراف بر برنامه علمی، نظارت بر روند مدیریتی، نظارت بر انتخاب اساتید، نظارت بر فعالیت کادر آموزشی و اجرایی، برگزاری جلسات مشورتی در موارد خاص و ... را از  وظایف خود می شمارد.